Nama : Akbar
NPM : 50411505
Kelas : 4IA05
Metode
kimia komputasi untuk tujuan disain molekul baru, tetutama senyawa obat, serta
prediksi sifat fisiko-kimia telah menjadi metode pilihan utama sebagian besar
industri farmasi berkaitan dengan pengembangan maupun penemuan obat. Aplikasi
metode yang juga disebut in silico ini, berawal dari postulat dasar
dalam paradigma disain obat klasik yang menyatakan bahwa efek obat dalam tubuh
manusia merupakan suatu konsekuensi “molecular recognition” antara ligan
(dalam hal ini obatdan sutau makromolekul (target).
Aktivitas
farmakologi ligan terhadap dudukan kerjanya (action site) sangat
ditentukan oleh tatanan ruang dan kerapatan elektron atom-atom ligan, dan juga
bagaimana atom-atom tersebut berinteraksi dengan molekul target atau “biological
conterpart” (Bohm & Klebe, 1996). Struktur, dinamika, dan interaksi
demikian memungkinkan suatu karakterisasi menggunakan kimia komputasi
dilakukan. Misalnya, pendekatan berbasis mekanika molekular (molecular
mechanics) secara efisien dapat membantu penemuan kandidat-kandidat obat
baru, dan metode komputasi yang tidak mahal ini sekarang secara rutin digunakan
di dalam disain obat (Jorgensen, 2004).